褐家鼠汉坦病毒黑龙江SC106分离株S基因特征分析

• 作者: 刘娣 刘彦成 张静 彭永刚 李冀宏 杨明 王开利 陈淑红 陈露菲
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 褐家鼠 汉坦病毒 S基因 特征
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 638-640
• 分类号: S855.3
• 字数: 2154字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2010.08.15

摘要

为研究家鼠型(SEO)汉坦病毒(HV)黑龙江分离株的分子特征,本研究对黑龙江省SEO型新分离株SC106的S基因进行了扩增和序列分析.结果表明:SC106株S基因全长由1775 nt组成,编码的蛋白长429 aa,符合SEO型编码.与HV参考毒株进行比较,SC106与SEO型同源性最高,与姬鼠型(HTN)相对较低,与其它型别同源性更低.N蛋白进化树分析表明,SC106位于SEO型病毒所在支系,与河南株R22,黑龙江株Pf26和北京株BiHD01亲缘关系接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性.序列分析表明:SC106与黑龙江省首个SEO型分离株Pf26均为SEO型中的S1亚型,它们的S基因核苷酸序列同源性也最高(99.2%),并且SC106的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守,由此证实,HV的进化与时间关系不大.