细菌聚类新方法:ddT聚类技术分析香根草联合固氮菌多样性

• 作者: 张志英 张桂权 张泽民 彭桂香 谭志远 赵现伟 邱永雄
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: ddT聚类 SDS-PAGE DNA指纹图谱 香根草 联合固氮菌
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 562-571
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/972009-1546

摘要

利用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,采用新型遗传分析仪Li-COR 4300L,结合测序的双脱氧链终止法原理,建立了基于16S rDNA序列T碱基分布特征的一种新的细菌多样性聚类技术--ddT聚类技术.应用该新的ddT聚类技术对分离自香根草的47株联合固氮菌多样性进行了聚类分析,获得了6个不同的主要类群,表明香根草联合固氮菌具有较大的遗传资源多样性.应用SDS-PAGE全细胞蛋白质电泳和DNA指纹图谱方法对该聚类结果进行验证,结果表明,该新聚类技术可以应用于细菌的多样性聚类分析.16S rDNA序列测定和系统发育分析表明,供试的联合固氮菌分别与y-变形杆菌纲(y-proteobacteria)的阴沟肠杆菌(Enterobactercloacae).Enterobacter ludwigii,Pantoea ananatis,恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida),荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)和β-变形杆菌(β-proteobacteria)的中型假食酸菌(Pseudaci-dovorax intermedius),Mitsuaria chitosanitabida,越南伯克氏菌(Burkholderia vietnamiensis),佛莱辛草螺菌(Herbaspirillum frisingense)亲缘关系相近,其中肠杆菌属、伯克氏菌属和泛菌属是香根草联合固氮菌的优势类群,分别占分离菌株总数的45%,19%和13%,它们一起构成了分离菌株总数的77%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张桂权		60	2015	25.0	44.0
2	彭桂香		48	517	12.0	22.0
3	谭志远		43	249	9.0	14.0
4	张泽民		28	679	11.0	26.0
5	赵现伟		1	0	0.0	0.0
6	张志英		1	0	0.0	0.0
7	邱永雄		1	0	0.0	0.0