甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因Dd-ace-1全长cDNA的克隆和序列分析

• 作者: 丁中 何琪 彭德良 高必达
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘薯茎线虫 乙酰胆碱酯酶 cDNA 克隆 聚类分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 437-441
• 分类号: Q781
• 字数: 3284字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1238.2010.00437

摘要

利用反转录聚合酶链式反应,结合快速扩增cDNA 末端(RACE)技术,克隆了甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶基因cDNA Dd-ace-1.该cDNA序列5′端存在反式剪接引导序列SL1,全长2 196 bp,包含1个1 908 bp的开放阅读框(GenBank登录号EF583059);在推导出的635个氨基酸残基的前体蛋白中, N 端的前24个氨基酸残基为信号肽, 随后的611个氨基酸残基是成熟的乙酰胆碱酯酶序列, 其预测的相对分子质量为70 144.12.在一级结构中, 形成催化活性中心的3个氨基酸残基 (Ser223、Glu360和His483)、胆碱结合位点Trp(106)以及在亚基内形成二硫键的6个半胱氨酸完全保守;在电鳐(Torpedo californica)乙酰胆碱酯酶分子的催化功能域中存在14个保守的芳香族氨基酸残基,其中10个在甘薯茎线虫乙酰胆碱酯酶中完全保守.该酶的氨基酸序列与南方根节线虫(Meloidogyne incognita)、胎生网尾线虫(Dictyocaulus viviparous)和秀丽小杆线虫(Caenorhabditis elegans)ACE-1的同源性为68.6%、67.2%和66.3%.与其他线虫乙酰胆碱酯酶的聚类分析显示,该乙酰胆碱酯酶(Dd-ACE-1)与其他线虫乙酰胆碱酯酶ACE-1同属一个支系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高必达	湖南农业大学生物安全科学技术学院	160	2331	25.0	39.0
2	丁中	湖南农业大学生物安全科学技术学院	19	307	10.0	17.0
3	彭德良		2	22	2.0	2.0
4	何琪	湖南农业大学生物安全科学技术学院	4	14	3.0	3.0