RNA二级结构的数学表示及其应用

• 作者: 徐丽 白凤兰
• 来源期刊: 大连交通大学学报
• 学科: 交通运输
• 关键词: RNA二级结构 向量夹角 L/L矩阵 特征值
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 105-108
• 分类号: U4
• 字数: 2634字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-9590.2010.06.026

摘要

根据RNA二级结构的基本序列在3-D空间中定义了使核苷酸集与点集之间一一对应的映射,进而利用这个映射在3-D空间中得到了RNA二级结构的新的3-D有向图形表示,然后基于3-D有向图形表示把RNA二级结构转化为特征向量序列和L/L矩阵,提取特征向量序列的夹角余弦和的平均值和L/L矩阵的不变量(特征值),并作为特征向量来刻画RNA二级结构,最后利用特征向量之间的距离来描述序列或结构的不变性来分析了AIMV-3等九种病毒的RNA二级结构的相似性,得到了比较好的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白凤兰	大连交通大学理学院	18	18	3.0	3.0
2	徐丽	大连交通大学理学院	1	1	1.0	1.0