一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析

• 作者: 李仁发 梁成 骆嘉伟
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: RNA二级结构 特征序列表示 相似性分析 Lempel-Ziv复杂度
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 软件技术研究
• 页码范围: 969-971,979
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.03.050

摘要

针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列.利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了相似性分析,实验结果表明了该表示法可以有效地提取RNA二级结构的结构信息,避免了不同RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李仁发	湖南大学计算机与通信学院	468	4582	30.0	44.0
2	骆嘉伟	湖南大学计算机与通信学院	53	417	12.0	18.0
3	梁成	湖南大学计算机与通信学院	2	7	2.0	2.0