miRNA基因和编码基因启动子区核小体定位分析

• 作者: 刘宏德 卢志远 孙啸 张德金 袁志栋 谢建明 马昕 龚乐君
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 核小体定位 启动子 miRNA基因
• 年，卷（期）: 2010,（14）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1335-1340
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11434-009-3730-2

摘要

研究了把基因启动子区的核小体定位对于分析基因的转录调控具有重要意义.利用核小体定位的预测技术--弯曲度谱,分析了编码基因和miRNA基因启动子周围核小体定位的特征.基因的转录起始位点处,有一个核小体缺失区域,且在下游约200 bp处,有较强的核小体定位信号.独立转录的内含子miRNA基因与基因间区miRNA基因,在启动子区具有相似的核小体定位特征,在上游0～-400bp间,有一个较宽的核小体缺失区域,在该区域分布有较多的转录因子结合位点;而依赖编码基因转录的内含子miRNA基因,其启动子与蛋白编码基因启动子具有相似的核小体定位特征,在转录起始位点上游-200～400 bp和-400～600 bp处,各有一个较强的核小体定位.这些结果表明,独立转录的miRNA基因(包括基因间区miRNA和独立转录内含子miRNA)和蛋白编码基因,在启动子区可能具有不同的核小体定位特征.核小体定位不仅参与编码基因的转录调节,也影响.miRNA基因的转录.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸		71	488	12.0	20.0
2	卢志远		3	32	1.0	3.0
3	谢建明		50	187	7.0	10.0
4	龚乐君		2	7	1.0	2.0
5	袁志栋		3	10	2.0	3.0
6	马昕		4	29	3.0	4.0
7	刘宏德		10	14	3.0	3.0
8	张德金		2	3	1.0	1.0