基于PCA和BP神经网络的O-糖基化位点的预测和模式分析

• 作者: 何伟 王楚正 谭晓风 陈延伟
• 来源期刊: 中南林业科技大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: O-糖基化 模式分析 主成分分析 BP神经网络
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 61-65,75
• 分类号: TP183
• 字数: 2952字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-923X.2010.09.011

摘要

糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一.传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本.为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O-糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列足否被糖基化.实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭晓风	中南林业科技大学林学院	181	2634	25.0	40.0
2	何伟	中南林业科技大学计算机与信息工程学院	4	4	2.0	2.0