分子动力学模拟和自由能计算研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式

• 作者: 刘新国 张少龙 张庆刚 扈国栋
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 孕酮受体 分子动力学 MM-PBSA 氢键
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 原子分子物理交叉学科
• 页码范围: 333-339
• 分类号: Q615
• 字数: 811字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2010.02.026

摘要

孕酮在确立和维持妊娠中起到了关键的作用. 为了研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式,进行了3.5纳秒的分子动力学模拟,用 MM-PBSA＼GBSA方法计算了结合自由能. 自由能分解和丙氨酸扫描两种方法说明,残基 Leu718, Met756, Met759, Phe778 和 Tyr890 对于结合抑制剂作用明显,这些残基的主要作用能是范德瓦尔斯作用能. 这一研究结果可以指导孕酮受体蛋白抑制剂的优化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
2	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
3	刘新国	山东师范大学物理与电子科学学院	33	93	5.0	7.0
4	扈国栋	山东师范大学物理与电子科学学院	8	32	4.0	5.0