抑制剂Benzamidine与胰岛素作用机制的分子动力学和结合自由能计算研究

• 作者: 伊长虹 李洪云 梁志强 王伟 王青 赵娟
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 胰岛素trypsin 分子动力学 结合自由能 抑制剂Benzamidine
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 原子分子物理交叉学科
• 页码范围: 951-956
• 页数: 6页
• 分类号: Q641.12
• 字数: 3965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2016.10.032

摘要

氢键和极性相互作用在抑制剂-蛋白结合专一性识别过程中起到重要作用。抑制剂Benzamidine ( BEN)与胰岛素trypsin相互作用机制的阐明有助于胰岛素高效抑制剂的研发。本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA( molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)从原子层次上研究BEN与胰岛素的结合模式。结果表明抑制剂BEN的脒基不仅与 Asp189的羰基产生静电相互作用,而且与残基 Ser190和Gly214形成氢键相互作用。基于残基能量分解的计算表明抑制剂的苯基与残基His58, Cys191, Gln192, Trp211, Gly212和Cys215形成有利于抑制剂结合的疏水性相互作用。期望当前的研究能为胰岛素有效抑制剂的研发提供重要的理论指导。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟	山东交通学院理学院	16	59	3.0	7.0
2	梁志强	山东交通学院理学院	20	50	3.0	5.0
3	伊长虹	山东交通学院理学院	13	39	3.0	5.0
4	李洪云	山东交通学院理学院	7	10	2.0	2.0
5	赵娟	山东交通学院理学院	4	8	2.0	2.0
6	王青	山东交通学院理学院	10	24	3.0	4.0