PTP1B选择性抑制剂的分子动力学模拟及结合自由能计算

• 作者: 方磊 计明娟
• 来源期刊: 中国科学院研究生院学报
• 学科: 化学
• 关键词: 蛋白质酪氨酸磷酸酯酶1B 分子动力学 结合自由能 能量分解 MM/GBSA
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 58-64
• 页数: 7页
• 分类号: O643
• 字数: 4151字
• 语种: 中文

摘要

作为二型糖尿病的潜在治疗药物,蛋白质酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)的抑制剂研究一直备受关注,而其中一种二齿类抑制剂由于其普遍较高的选择性和活性,又是抑制剂的研究重点和热点,采用分子动力学方法取样,MM/GBSA方法计算了1个二齿类PTP1B抑制剂与PTPlB及其2个同家族酶TCPTP和SHP-2的结合自由能,得到了与实验活性值相符的结果.同时基于MM/GBSA的能量分解计算表明,抑制剂与,PTP1B第2位点附近的2个残基ARG24和ARG254有很强的相互作用,与其他2个酶第2位点的相互作用则有所减弱,尤其是SHP-2,几乎没有实质性相互作用,这应该是抑制剂产生选择性的关键,同时活性位点附近的残基PHE182也与抑制剂分子有很强的相互作用,相比‘TCPTP也有很大优势,希望这些信息在进一步提升PTP1B抑制剂的选择性和活性方面提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	计明娟		13	84	5.0	8.0
2	方磊		3	11	2.0	3.0