抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶作用模式的结合自由能计算研究

• 作者: 伊长虹 张少龙 张庆刚 梁志强 王伟 陈建中
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 分子动力学 结合自由能 HIV-1蛋白酶
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 原子分子物理交叉学科
• 页码范围: 855-860
• 页数: 6页
• 分类号: Q641.12
• 字数: 3668字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2013.05.027

摘要

本文采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究了抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶的作用机制.研究结果表明范德华作用主导了抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶的结合.基于残基的自由能计算表明残基Gly49、Ile50、Val82、Ile84、Gly27'、Ala28'、Ile50'和Ile84'与G4G产生了较强的相互作用,同时研究也表明CH-π,CH-O相互作用和氢键是其主要的作用形式.该研究能为以HIV-1蛋白酶为靶标的抗艾滋病药物设计提供理论上的指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟	山东交通学院理学院	16	59	3.0	7.0
2	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
3	梁志强	山东交通学院理学院	20	50	3.0	5.0
4	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
5	陈建中	山东交通学院理学院	9	18	3.0	4.0
6	伊长虹	山东交通学院理学院	13	39	3.0	5.0