H IV-1蛋白酶与抑制剂 BEG 相互作用的分子对接计算研究

• 作者: 伊长虹 张少龙 张庆刚 梁志强 王伟 陈建中
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 工学
• 关键词: 分子动力学 结合自由能 H IV-1蛋白酶 分子对接方法
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 原子、分子结构与光谱
• 页码范围: 718-723
• 页数: 6页
• 分类号: TQ321
• 字数: 3927字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2014.05.006

摘要

本文使用分子对接方法和MM/PBSA方法计算抑制剂BEG与 HIV-1蛋白酶的结合自由能，结果表明范德华相互作用主宰了BEG与 HIV-1蛋白酶的结合，还证明分子对接采用的分子力场相比于Amber12力场更适合于BEG-HIV蛋白酶系统。本文采用基于残基的自由能分解方法计算了抑制剂-残基相互作用，结果表明残基Leu23、Gly49、Ile50、Val82、Ile84、Asp25′、Gly27′、Ala28′、Gly49′、Ile50′和Ile84′与BEG产生了较强的相互作用，同时也证明CH-π和CH-O相互作用驱动了抑制剂BEG与HIV-1蛋白酶的结合。我们期望这个研究能为艾滋病治疗药物的合理化设计提供理论上的指导和实验上的参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟	山东交通学院理学院	16	59	3.0	7.0
2	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
3	梁志强	山东交通学院理学院	20	50	3.0	5.0
4	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
5	陈建中	山东交通学院理学院	9	18	3.0	4.0
6	伊长虹	山东交通学院理学院	13	39	3.0	5.0