桑种质资源ITS序列与系统进化分析

• 作者: 余茂德 刘秀群 陈仁芳 陈龙清
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桑 ITS 指纹鉴别 进化关系
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1771-1781
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.09.002

摘要

[目的]分析桑ITS序列,为桑系统位置、进化关系、DNA指纹鉴别、育种亲本选择提供分子生物学依据.[方法]利用收集的73份桑资源,总DNA提取,PCR扩增,测序,并从GenBank下载桑科Moraceac,桑属Morus ITS序列,软件分析ITS长度、变异位点、G+C含量、遗传分歧.同源性百分比差异、系统位置与进化关系.[结果]获得ITS完整序列,基本序列全长576 bp,G+C含量59.55%.(ITS1:174 bp,G+C含量61.49%,ITS2:302 bp,G+C含量62.25%,5.8s:100 bp,G+C含量48.00%).序列比对表明,共166个变异位点,(ITS1:100,ITS2:66,5.8S:0),一些变异位点有明显的种性特征,可作为特异DNA指纹鉴别位点.最大遗传分歧4.0,山桑(M.bombycis)与其它栽培种遗传分歧0.9-1.4.基于ITS桑系统位置,在非洲硬木树(Milicia oxcelsa,MEU93585)与新西兰鹊肾树(Streblusglaber,DQ499105)之间,与非洲硬木树(MEU93585)亲缘关系最近.Mrbayes分析,新疆黑桑(M.nigra),北美默里桑(M.murryana,FJ605515)最原始,进化顺序为新疆黑桑,北美默里桑→白桑(M.alba)→华桑(M.cathayana)→长穗桑(M.wittiorum).[结论]ITS长度、G+C含量、变异位点均可作桑种质资源DNA特异指纹鉴别的依据,特别是碱基变异位点.桑属劳亚古陆(Laurasia)高纬度起源,由北向南迁移.桑属可由地理分布间接反映系统进化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈龙清	华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室	72	1285	22.0	33.0
2	刘秀群	华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室	10	120	8.0	10.0