红灯食烷菌(Alcanivorax hongdengensis)黄素结合单加氧酶(AlmA)的基因克隆及其烷烃诱导表达

• 作者: 王万鹏 邵宗泽
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 食烷菌 长链烷烃 支链烷烃 黄素结合单加氧酶(AlmA) 生物降解
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1051-1057
• 分类号: Q939
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究海洋烷烃降解菌新种模式菌株Alcanivorax hongdengensis A-11-3降解长链烷烃的分子机制.[方法]PCR克隆编码黄素结合单加氧酶的基因序列,利用生物信息学软件对序列进行分析,运用RTPCR和实时荧光定量PCR技术分析基因在不同烷烃诱导下的表达水平.[结果]从菌株A-11-3中克隆获得了两个黄素结合单加氧酶基因片段(almA1和almA2).它们编码的氨基酸序列与菌株Acinetobacter sp.DSM 17874的AlmA同源性分别为58.6%和53.2%.实时荧光定量PCR分析表明,almA1基因只在长链烷烃(C28-C32)的诱导下上调表达,而almA2基因中能在更宽范围的长链烷烃(C24-C34)和支链烷烃诱导下上调表达.两者均在C9-C22的烷烃诱导下没有上调表达.[结论]黄素结合单加氧酶可能是A-11-3降解长链烷烃和支链烷烃的关键酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵宗泽	国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室	39	675	16.0	24.0
2	王万鹏	厦门大学生命科学学院	1	12	1.0	1.0