间日疟原虫乳酸脱氢酶编码区全长基因的克隆、序列分析及线性B细胞表位预测

• 作者: 夏惠 常雪莲 方强 王雪梅 高琪 齐文娟
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 间日疟原虫 乳酸脱氢酶 克隆 序列分析 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 519-523
• 分类号: R282.3
• 字数: 4215字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.06.003

摘要

目的 克隆中国间日疟原虫乳酸脱氢酶(PvLDH)编码区全长基因,并对其进行生物信息学分析.方法 自间日疟原虫抽提RNA,根据已知的PvLDH基因设计特异性引物,采用RT-PCR扩增PvLDH编码基因,将其克隆至pMD18-T载体,经PCR和双酶切鉴定后进行序列测定,利用生物信息学在线工具对序列进行分析并做B细胞表位预测.结果 PCR 产物电泳结果显示所克隆的基因为951bp,基因测序结果与GenBank 报道的基因序列有一个碱基差异,但编码氨基酸无差异.在线分析预测出12个B细胞表位,与恶性疟原虫乳酸脱氢酶预测表位对比分析,发现一个PvLDH特异性表位.结论 成功克隆了我国间日疟原虫乳酸脱氢酶编码区全长基因,并预测出1个PvLDH特异性线性B细胞表位.