甲型H1N1流感病毒HA基因进化与蛋白特征分析

• 作者: 周小东 曾照芳 李明强
• 来源期刊: 激光杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 甲型H1N1 流感病毒 HA 生物信息 糖基化位点 抗原位点
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 激光医学与医学
• 页码范围: 75-78
• 分类号: Q811
• 字数: 4475字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-2743.2010.05.038

摘要

目的:通过对甲型H1N1流感病毒的HA基因序列进行分析,揭示其基因的变异性与本次疫病流行的内在因素的关系.方法:运用DNAStar、DNAMAN、Modeller 9V6和在线分析软件等生物信息学手段对HA基因和蛋白进行比较分析.结果:甲型H1N1流感毒株的HA基因来源于猪源谱系流感病毒,免疫压力比较小,基因重组融合了人流感病毒基因片段.甲型H1N1流感病毒HA蛋白裂解位点氨基酸性质保守,碱性氨基酸不足,但潜在表位整体电势发生改变影响到抗体分子的识别和结合.HA蛋白多个抗原位点发生显著变化,并且有3糖基化位点就发生在抗原决定簇上;结论:HA基因重组导致HA蛋白变异致使抗原改变,造成人群普遍缺乏特异性免疫力,导致流感暴发与大规模流行.