苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因cry1A的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴钢 张志勇 彭正松 朱旭东 王闵霞 蒲志刚 蔡平钟 赵直
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: cry1A基因 苏云金芽孢杆菌 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护·土壤肥料
• 页码范围: 393-398
• 分类号: S432.4+2
• 字数: 4039字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4829.2010.02.022

摘要

以分离的3株苏云金芽孢杆菌质粒为模板,通过设计一对特异引物,PCR扩增得到3条全长3.6 kb的基因序列,其各自都包含一个完整的开放阅读框,编码序列全长分别是3468、3450、2697 bp(Genebank登录号分别为GQ385073,GQ385074,GQ385075);它们与cry1A类基因同源性都高达95 %以上;分别编码1159、1150和902个氨基酸.并在此基础上采用生物信息学方法对这3个基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域以及功能域等方面进行了预测和分析.为转基因抗虫植物和微生物杀虫工程菌的构建提供了基因来源.