苏云金芽胞杆菌cry1Ib2基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 关夏玉 关雄 张永嵘 黄天培
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苏云金芽胞杆菌 cry1Ib2基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 1266-1271
• 分类号: S432.42|Q785
• 字数: 3240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.08.006

摘要

BRC-ZLL4是一株从鱼尾葵(Cargota mitis Lour)上分离到的,对柑橘凤蝶幼虫具有毒性的苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)菌株.本试验采用PCR-RFLP技术鉴定该菌株中含有cry1Ib基因.设计一对特异引物,分别引入Sal Ⅰ和BamH Ⅰ酶切位点.以BRC-ZLIA的总DNA为模板,扩增cry1Ib全长基因.生物信息学分析表明,该基因全长2 160 bp,编码一个由719个氨基酸组成的、相对分子质量为81.39 ku、等电点为6.425的蛋白.该基因已在GenBank上登录(登录号为EU233027),并被Bt δ-内毒素国际命名委员会正式命名为cry1Ib2.信号肽预测显示,Cry1Ib2蛋白没有信号肽,为胞内蛋白.二级结构预测显示,在Cry1Ib2蛋白二级结构中,25%为α-螺旋,28%为β-片层,18%为β-转角,29%为无规则线圈.此外还对Cry1Ib蛋白的功能区和三级结构进行了预测和分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄天培	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	22	93	4.0	8.0
5	关夏玉	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
9	张永嵘	福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0