ICRISAT花生微核心种质资源SSR标记遗传多样性分析

• 作者: 任小平 姜慧芳 廖伯寿 张晓杰 陈玉宁 雷永 黄家权
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 花生(Arachis hypogaea L.) SSR 遗传多样性 核心种质
• 年，卷（期）: 2010,（14）
• 页码范围: 2848-2858
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.14.003

摘要

[目的]评价ICRISAT花生微核心种质资源的遗传多样性水平,揭示ICRISAT花生微核心种质资源遗传多样性,验证传统植物学分类的可靠程度,为充分发掘、利用ICRISAT花生微核心种质资源提供必要信息.[方法]采用27对花生SSR引物,对ICRISAT微核心花生种质168份材料(来自世界五大洲42个国家)进行遗传多样性分析;利用NTSYS-pc V2.0软件进行主成分分析(PCA)并绘制三维空间聚类图;利用Popgene V1.32估算种质群间的Nei78遗传距离等参数并进行UPGMA聚类分析,采用MEGA 3.1绘制种质群间聚类图. [结果]27对SSR引物共扩增出115条多态性条带,每对引物平均扩增出4.2930个等位变异,其中有效等位变异数2.7931,有效等位变异所占比重为65.49%;PM137、16C6、14H6、8D9和7G02等引物最为有效,其Shannon's信息指数均在1.5以上,等位变异数5个以上,有效变异数3.7个以上.在多粒型群体中,来源于南美洲和印度种质资源的遗传多样性较低,来源于南美洲和非洲种质资源的遗传多样性较高;在珍珠豆型群体中,来源于北美洲种质资源的遗传多样性较低,来源于南美洲和非洲种质资源的遗传多样性较高;在普通型群体中,来源于北美洲种质资源的遗传多样性较低,来源于南美洲、美国和非洲种质资源的遗传多样性较高.来自南美洲的花生种质资源具有较高的遗传多样性,与花生起源于南美洲的结论一致.PCA分析,发现栽培种花生种质资源由4个差异明显的基因源构成,"hypogaea"包括普通型种质资源, "vulgaris"包括珍珠豆型种质资源, "fastigiata 1"包括多粒型种质资源,"fastigiata 2"包括多粒型种质资源.植物学分类单位间的Nei78遗传距离介于16.336-23.607 cM,UPGMA聚类方法将花生属植物学分类单位聚成5个组群,"组群1"对应"hypogaea"基因源,"组群2"对应"vulgaris"基因源, "组群3"对应"fastigiata 1"、 "fastigiata 2"基因源之和, "组群4"和"组群5"分别代表秘鲁型和赤道型基因源,聚类结果支持4个基因源的划分.[结论]ICRISAT花生微核心种质资源具有丰富的遗传多样性,不同来源的变种群间存在明显的遗传差异,并分化成4个基因源,研究结果部分支持栽培种花生传统的植物学分类体系.为拓宽花生育成品种的遗传基础,应充分发掘ICRISAT微核心种质各基因源的遗传潜力.