湖南湖北两省H_6亚型禽流感病毒表面基因的序列分析

• 作者: 丁晴微 于杨 崔佳莹 崔鹏飞 施建忠 李印 邓国华 邱伯根 陈化兰 齐瑛琳
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 农学
• 关键词: 禽流感病毒 H6亚型 HA NA 基因分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 282-287
• 分类号: S855.3
• 字数: 4081字
• 语种: 中文

摘要

2008年至2009年间,在湖南和湖北两省的活禽市场中分离到了14株H6亚型禽流感病毒,为了解这14株病毒之间的分子特征和差异,我们运用PCR和测序鉴定对这14株病毒的NA基因进行了分型,并对其表面基因HA和NA进行序列测定及序列分析。14株H6亚型病毒中,H6N2亚型12株,H6N6亚型2株。序列测定和进化分析结果显示：DK/HN/284的HA基因与其它13株的HA差异性较大,差异性达到19.4%～20.2%,其余13株毒同源性在94.2%～99.9%;N2亚型NA基因的同源性在91.1%～99.9%,差异性比较大;两株N6亚型NA基因同源性为89.5%,差异明显。这些数据表明：不同毒株呈现一定的地域性差异。与我国周边其它地区的H6亚型禽流感毒株序列进行比较发现,只有DK/HN/284的HA基因与香港早期的毒株可能有着共同的来源,其余都与香港和韩国等的毒株有着较大的差异性,并且各个毒株的HA基因上潜在的糖基化位点和受体结合位点也有所不同,这些数据表明,这些毒株表现出明显的异源性。