三维氨基酸描述子(SVTD)在HLA-A*0201限制性CTL表位肽QSAR中的应用

• 作者: 张生万 李美萍 陈婷
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: 三维氨基酸描述子SVTD 表位肽 多元线性回归 定量构效关系模型
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 78-82
• 分类号: O641
• 字数: 3098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2011.01.017

摘要

应用新型的三维氨基酸描述子-SVTD对65个HLA-A 0201 限制性CTL表位肽进行结构表征,通过多元线性回归对其结构与活性的关系建立定量构效关系 QSAR 模型,采用内外双重验证的办法分析验证模型的稳定性,建模计算值,留一法(leave-one-out,LOO)交互检验预测值和外部样本预测值的相关系数R,Rcv,Qext分别为:0.949,0.899,0.922.表明SVTD描述子能够系统地表征肽与生物活性相关的结构,且所产生的定量构效关系模型,预测 HLA-A*0201 活性的能力较好,可以为改造CTL表位肽结构提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张生万	山西大学生命科学学院	158	1069	16.0	22.0
2	李美萍	山西大学生命科学学院	83	599	14.0	20.0
3	陈婷	山西大学化学化工学院	4	14	2.0	3.0