植物内生细菌XG32菌株16S rRNA寡核苷酸探针杂交条件优化和特异性验证

• 作者: 刘佳 王梅霞 闫淑珍 陈双林
• 来源期刊: 南京师大学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 荧光原位杂交 杂交条件优化 特异探针验证
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 89-95
• 分类号: Q938.1
• 字数: 5553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4616.2011.01.019

摘要

为了能利用荧光原位杂交方法来研究植物内生细菌XG32菌株在植物体内的定殖和分布,利用XG32菌株的16S rRNA中段特异性序列和Genbank数据库,用BLAST、DNAclub和Oligo软件设计了一个在理论上具有特异性的探针,在优化该探针的杂交条件基础上,通过与12个亲缘关系相邻和相近的菌株反复杂交来验证探针的特异性.结果显示,XG32探针适宜的杂交条件为:杂交缓冲液中甲酰胺浓度为35%,NaCl浓度为1.2 mol/L,杂交温度为42℃,清洗缓冲液中NaCl浓度为0.02 moL/L;探针与XG32菌株杂交信号明显,与其他菌株均不能杂交.综上所述,设计的探针是XG32菌株的特异性探针.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈双林	南京师范大学生命科学学院江苏省微生物工程技术研究中心	71	771	13.0	24.0
2	闫淑珍	南京师范大学生命科学学院江苏省微生物工程技术研究中心	46	471	12.0	20.0
3	刘佳	南京师范大学生命科学学院江苏省微生物工程技术研究中心	12	36	3.0	5.0
4	王梅霞	南京师范大学生命科学学院江苏省微生物工程技术研究中心	9	323	6.0	9.0