斜带石斑鱼MyD88基因的克隆与表达

• 作者: 昌明先 罗廷荣 韦友传 高谦
• 来源期刊: 基因组学与应用生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 斜带石斑鱼 表达 髓样分化因子88(MyD88)
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 288-295
• 分类号: Q78
• 字数: 4446字
• 语种: 中文

摘要

本研究运用RACE-PCR技术获得斜带石斑鱼（Epinephelus coioides）髓样分化因子88（myeloid differentiation factor 88,MyD88）基因,并对该基因进行生物信息学和表达模式分析。研究结果表明1795bp的cDNA全长序列,包括ORF 870 bp、5＇UTR 243 bp和3＇UTR 682 bp,3＇UTR存在1个多聚腺苷酸加尾信号（AATAAA）和两个mRNA不稳定基序（ATTTA）。SMART软件预测该蛋白N端和C端分别存在死亡结构域和TIR结构域（Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR）;与其它脊椎动物MyD88的序列同一性达57.1%～78.7%;用NJ法构建的系统进化树中,斜带石斑鱼MyD88和其它已报导的鱼类MyD88聚为一枝。qPCR检测结果显示MyD88基因mRNA主要表达于肝脏、脾脏、头肾和胸腺等组织。本研究为进一步探讨MyD88在斜带石斑鱼TLR信号传导中的作用奠定基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高谦	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	61	988	11.0	30.0
2	罗廷荣	广西大学亚热带生物资源保护利用重点实验室	40	314	11.0	15.0
3	韦友传		1	10	1.0	1.0
4	昌明先	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	2	16	2.0	2.0