基于混合患病兄弟对IBD数据的连锁分析

• 作者: 崔文泉 李凯
• 来源期刊: 高校应用数学学报A辑
• 学科: 生物学
• 关键词: 患病兄弟对 连锁分析 似然比检验 混合模型 可识别性
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 12-20
• 分类号: Q348
• 字数: 5647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4424.2011.01.002

摘要

患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)设计在遗传统计中有着广泛的应用,这种设计针对的是完全兄弟对(full-sib),而在实际问题中,被抽样的患病兄弟对中常会混有一定数目的半兄弟对(half-sib).论文对这种基于IBD信息的混有半兄弟对NASP(称为mixed affected sib-pair,简记MASP)新数据类型进行连锁分析,特别是对似然比检验进行了详细的讨论.研究表明,仅有IBD信息的MASP数据,所得到的统计模型是不可识别的,且ASP设计中普遍采用的比例检验和均值检验不能使用.文中通过追加信息的手段解决了上述的不可识别性,随后对模型参数的估计给出了EM算法,证明了似然比检验的渐近零分布服从自由度为3的卡方分布.最后进行了统计模拟研究,模拟结果显示所给的检验方法在小样本情形下具有良好的表现.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔文泉	中国科学技术大学统计与金融系	8	10	2.0	3.0
2	李凯	中国科学技术大学统计与金融系	64	329	9.0	15.0