杂色鲍血蓝蛋白HtH1基因第16内含子 SNP密度的分析

• 作者: 柯才焕 梁翠 游伟伟 王德祥 陈军
• 来源期刊: 台湾海峡
• 学科: 生物学
• 关键词: 海洋生物学 SNP EPIC 血蓝蛋白基因HtH1 杂色鲍
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 21-26
• 分类号: Q755
• 字数: 4470字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1000-8160.2011.01.004

摘要

单核苷酸多态性(SNPs)是继RFLP和SSR多态性标记之后的新一代遗传标记系统.本文采用EPIC的方法,分析了45个杂色鲍样品的血蓝蛋白HtH1基因第16内含子(H1 intron 16)的SNP数据.这45个个体分别来自日本、台湾和汕头3个不同海域的野生或养殖群体.日本群体的血蓝蛋白HtH1基因第16内含子呈现出长度多态性,共有3种不同长度,分别是1 900、780、440 bp,测序结果表明3个等位基因可以互相比对;而台湾和汕头杂色鲍养殖群体的均为1 900 bp.初步研究结果表明日本杂色鲍个体大约96 bp长的片段含有1个自身杂合SNP位点;台湾杂色鲍个体约133 bp含有1个自身杂合SNP位点;汕头杂色鲍个体约153 bp含有1个自身杂合SNP位点.13个台湾杂色鲍个体包含的SNP密度为约31 bp含有1个SNP;23个汕头杂色鲍个体包含的SNP密度为约 21 bp 含有1个SNP.这些数据表明现有的杂色鲍养殖群体包含了丰富的SNP位点,利用SNP分子标记进行高密度遗传图谱的构建是可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柯才焕	厦门大学海洋与环境学院	72	850	18.0	25.0
2	王德祥	厦门大学海洋与环境学院	36	732	15.0	26.0
3	游伟伟	厦门大学海洋与环境学院	18	126	6.0	10.0
4	陈军	厦门大学海洋与环境学院	14	51	4.0	6.0
5	梁翠	厦门大学海洋与环境学院	1	0	0.0	0.0