树莓SSR反应体系的优化及应用

• 作者: 姜明 孥少守 张玉平 潘青华 许奕华 金万梅 韩振海
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 树莓 SSR 体系优化 应用
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 页码范围: 58-63
• 分类号: S663.2
• 语种: 中文

摘要

本研究主要对树莓SSR-PCR体系进行优化,以‘来味里（Reveille）’红树莓为试材,利用L9（34）正交试验设计和两因素完全随机试验,研究各主要参数的适宜浓度,建立适合树莓SSR反应的最佳体系,并通过16个不同的树莓栽培品种对优化后的体系进行验证。结果表明：各影响因素中,引物浓度的变化对扩增结果的影响最大,优化后的最佳反应体系（25μL）中,Taq DNA聚合酶和DNA最适用量分别为1.0U和30ng;Mg2＋、dNTP和引物最适浓度分别为1.5、0.2mmol/L和0.4μmol/L。利用优化后的反应体系和10对SSR引物对16个树莓品种进行PCR扩增,不同品种间扩增结果稳定,多态性位点丰富,共有54个等位位点,表明该体系稳定可靠,适合树莓的SSR分析。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩振海	中国农业大学农学与生物技术学院	156	3213	31.0	48.0
2	潘青华	北京市农林科学院林业果树研究所	55	818	14.0	27.0
3	许奕华	北京市农林科学院科研处	30	210	9.0	12.0
4	金万梅	北京市农林科学院林业果树研究所	34	538	13.0	22.0
5	孥少守	北京市农林科学院林业果树研究所	1	8	1.0	1.0
6	姜明	北京市农林科学院林业果树研究所	3	22	3.0	3.0