复杂信号通路模型参数估计的直接微分法

• 作者: 刘太元 贾建芳
• 来源期刊: 中北大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 信号转导通路 参数估计 直接微分法 平滑样条
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 自动化与计算机技术
• 页码范围: 697-701
• 分类号: TP27
• 字数: 2935字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-3193.2011.06.009

摘要

针对细胞信号通路模型的强非线性、模型参数的不确定性以及受噪声干扰的实验数据等特点,提出一种新的参数优化算法——直接微分法,估计复杂信号转导通路模型的未知参数.该方法首先采用平滑样条拟合测量数据,然后对拟合多项式进行求导来估计模型状态变量的一阶微分,从而将动态优化问题转化为线性或非线性回归问题.以TNFα诱导NF-κB信号转导通路模型为例,利用直接微分法估计未知参数,并分析了不同因素对参数估计结果的影响.仿真结果表明:该方法能够有效估计模型的未知参数,且无需迭代求解微分方程组,降低了计算复杂度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾建芳	中北大学信息与通信工程学院	34	162	7.0	11.0
2	刘太元	中海石油研究中心技术研究部	15	188	8.0	13.0