丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析

• 作者: 化文平 周露 李翠芹 杨滢 王喆之
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 丹参 异戊烯焦磷酸异构酶 生物信息学分析 实时荧光定量PCR 表达模式
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1086-1090
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)是萜类合成途径的关键酶之一.本文在丹参转录组高通量数据分析的基础上,对丹参IPI基因(SmIPI)进行了克隆及序列分析.SmIPI全长1 234 bp,包含681 bp的开放读码框,编码226个氨基酸.生物信息学结构分析表明,SmIPI为亲水性α/β蛋白,包含有IPI结构域,在序列组成、结构及活性位点等方面与其他植物的IPI均具有高度的相似性.实时荧光定量PCR分析结果表明,SmIPI在丹参生长的各个时期和不同组织器官中差异表达,其表达受病原菌和茉莉酸甲酯的诱导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王喆之		155	1966	25.0	35.0
2	李翠芹		14	53	4.0	7.0
3	化文平		9	79	4.0	8.0
4	杨滢		2	0	0.0	0.0
5	周露		6	14	2.0	3.0