鸡脂肪性状重要候选基因的连锁不平衡模式分析

• 作者: 户国 李晓存 李辉 王守志
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 脂肪性状 候选基因 连锁不平衡模式 ∣D'∣ r2
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 278-286
• 分类号: S828.2
• 字数: 5850字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2011.02.012

摘要

对鸡脂肪性状候选基因进行连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析可以为理解鸡体脂沉积的遗传学机制提供重要信息,并且可以提高脂肪性状相关分子遗传标记的检出效率.本研究以东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系第8世代肉仔鸡为实验材料,通过直接测序、高效液相色谱(DHPLC)、单链构象多态性(PCR-sscv)、限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、长度多态性(PCR-LP)等方法对过氧化物酶增殖体激活受体(PPAR-γ)、载脂蛋白B(ApoB)、解耦联蛋白(UCD)以及其他10个鸡脂肪性状重要候选基因进行多态性检测,计算候选基因标记间LD参数∣D'∣与r2,分析这些候选基因标记间的LD模式并探讨其规律.初步发现了以下特征:1、在各候选基因内,标记间的∣D'∣与r2值并不匹配,取值区间差异很大,∣D'∣值普遍大于r2;另外,在有些基因内的相同标记间,∣D'∣、r2值相差很大,甚至在∣D'∣=1时,r2接近于0.2、在不同基因甚至在同一基因内不同区域LD水平差异很大且物理距离与LD关系并不成线性关系.3、在有些基因内,如ApoB基因,相间位点间的∣D'∣和r2值大于相邻位点间的值.4、有些基因,如PPAR4-γ,相同标记间LD水平在高、低脂系间存在很大差异.本研究结果提示,在群体遗传学研究中进行候选基因LD分析时,LD参数r2的应用价值比∣D'∣更大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王守志	东北农业大学动物科学技术学院	18	186	8.0	13.0
2	李辉	东北农业大学动物科学技术学院	142	1989	22.0	39.0
3	户国	东北农业大学动物科学技术学院	7	68	4.0	7.0
4	李晓存	东北农业大学动物科学技术学院	2	1	1.0	1.0