鸭骨形成蛋白4基因的克隆和序列分析

• 作者: 张爱玲 张豪 李加琪 杨承忠 王翀 王茜
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 骨形成蛋白 克隆 RT-PCR 蛋白预测
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 83-88
• 分类号: S831.1
• 字数: 4457字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2011.01.018

摘要

通过比较基因组学方法,采用RT-PCR技术克隆了鸭骨形成蛋白4(BMP4)基因的1 256 bp cDNA序列,包含44 bp的5'非翻译区和1 212 bp的完整编码序列(编码404个氨基酸);对该基因的结构分析得知鸭BMP4基因包含2个外显子和1个内含子.经同源比对发现该编码序列与鸡的BMP4基因相似性达95.5%,15个物种的该基因成熟肽相似性很高.系统进化分析发现禽类包括鸭和鸡同两栖类、鱼类归为一大类;蛋白质预测结果显示,鸭BMP4基因1~19氨基酸序列为信号肽,与疏水、跨膜区域重合,相对分子质量为46 074,等电点是8.87;二级结构中近1/3为α-螺旋,三级结构由7个α-螺旋和2个卢β-折叠片构成.