建鲤生长激素受体基因分离、转录子多态性以及组织表达特性

• 作者: 俞菊华 唐永凯 李建林 李红霞 董在杰
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 建鲤 生长激素受体基因 旁系同源基因 组织表达
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 218-228
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 8818字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00218

摘要

使用PCR、RT-PCR和RACE方法分离克隆了建鲤基因组内的4个jlGHRs基因,同源性分析和系统树表明它们两两分属于鱼类GHR1和GHR2,命名为jlGHR1a、jlGHR1b;jlGHR2a、jlGHR2b.jlGHR1s和jlGHR2s的两个旁系同源基因间氨基酸差异分别为5%和11%,但功能保守区FGVFS基序、Box1、Box2基本一致,jlGHR1s和jlGHR2s氨基酸差异为41%.jlGHRs和斑马鱼GHRs基因结构相同,在阅读框内存在7个内含子,两旁系同源基因间内含子长度或序列存在差异.jlGHR1s、jlGHR2s与不同鱼类GHR1、GHR2同源性高低与传统分类地位一致.实验过程中发现建鲤肝脏存在jlGHRs的多种转录子,包括丢失了外显子4的jlGHR1b'、保留了内含子3的jlGHR2a'、丢失了部分外显子8的jlGHR2as.实时定量RT-PCR组织表达结果显示4个jlGHRs在脑、肝、心、头肾、肾、肠、脾、肌肉各组织中均有表达,但表达量差异明显,其中肌肉组织中4个基因表达量均最高,脑中4个基因的表达水平相当,其余各组织中jlGHR2b的表达量均最高.从多转录子和较低表达量推测jlGHR2a所受的选择压力低于jlGHR2b.鲤鱼基因组内分离到GHR1、GHR2的两个旁系同源基因在功能基因方面证实了鲤鱼体内存在两套基因,表明鲤鱼是研究同源基因变异分化的好材料,也为今后正确查找jlGHRs基因上的SNP位点奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建林	中国水产科学院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室	38	631	15.0	24.0
2	唐永凯	中国水产科学院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室	28	459	11.0	21.0
3	俞菊华	中国水产科学院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室	38	655	17.0	24.0
4	李红霞	中国水产科学院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室	14	131	7.0	11.0