人类基因组isochore边界的保守性研究

• 作者: 刘红 华琳 李林 郑卫英 郑文新
• 来源期刊: 中国优生与遗传杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Isochore边界 人类基因组 保守性
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 分子、生化遗传学与PCR技术
• 页码范围: 32-33,42
• 页数: 3页
• 分类号: R343.1
• 语种: 中文

摘要

人类基因组由一些较长的,G+C含量相对均匀的DNA片段组成,也就是我们所说的isochore结构.Isochore结构与许多重要的生物学特征相关,如:基因密度、CpG岛等,关于这些已有系统的研究.我们使用基于Z曲线理论的基因组序列分段算法,在单核苷酸精度的水平上定位了人类基因组56个isochore的边界,共得到79个独立的边界.我们发现在这79个边界中,45.6%的isochore边界在与17个脊椎动物基因组比对时,显示出明显的保守性,比如:某段高保守的序列在isochore边界处转换为一段弱保守或者完全不保守序列.另外isochore边界附近的序列组成高度保守.通过和已被实验证实的复制开关点附近的序列相比较.有理由推断这79个isochore边界都有可能是人类基因组中的复制开关位点,这一点有待实验验证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	华琳		100	538	11.0	21.0
2	李林		198	1395	21.0	29.0
3	刘红		121	458	11.0	16.0
4	郑文新		9	16	3.0	3.0
5	郑卫英		30	45	5.0	5.0