食用菌纤维素内切酶的分子建模与分析

• 作者: 易卓林 茆灿泉 黄婷婷
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 分子建模 纤维素内切酶 食用菌
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术工程
• 页码范围: 584-588
• 分类号: Q71
• 字数: 3791字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2286.2011.03.032

摘要

采用SWISS-MODEL、Discovery Studio等生物信息方法预测和分析食用菌纤维素内切酶(EG)分子的三级结构.结果显示:草菇(V.volvacea)和云芝(T.hirsuta)EG的分子外形呈“桶”状,由外层的alpha -螺旋和内层的beta-折叠组成,无规卷曲位于其2个底面；草菇EG的R129作为盐键形成中心,参与形成6个盐键,其催化残基E215和E248参与形成5个氢键,而里氏木霉(T.reesei) EG II的催化残基参与形成3个氢键.基于EG连接区和催化相关序列氢键分析,认为草菇和云芝的该区域相关碱基或氨基酸可进行突变和优化.目前未见对草菇和云芝EG的分子建模的研究报道.此研究对于食用菌纤维素内切酶结构的深入了解和结构优化及应用具有重要的意义和价值.