牛病毒性腹泻病毒基因2型代表株全基因组序列分析

• 作者: 孙宏进 孟祥升 朱国强 朱礼倩 林燕清 王建业 陶洁
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: BVDV-2 XJ-04株 基因组测序 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 23-27
• 分类号: S852.65
• 字数: 3210字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2011.01.06

摘要

为了解我国牛病毒性腹泻(BVD)的分子流行病学情况,本研究对分离的3株牛病毒性腹泻病毒基因2型(BVDV-2)代表株全基因组进行序列分析,应用RT-PCR法分段扩增3株BVDV-2(XJ-04、SD-09和QH-09)的全基因组序列,共分为18个片段:A～Q以及5'-UTR和3'-UTR的部分序列.除5'-UTR和3'-UTR部分序列外,A～Q基因片段末端相互重叠.经序列拼接获得3株全基因组序列,全长均为12 284 bp.将测序结果与GenBank登录的瘟病毒科代表毒株序列、自我裂解酶(Npro)、结构蛋白(C、Ems、E1、E2)以及标准株BVDV-1 NADL和BVDV-2 890进行核苷酸以及氨基酸序列同源性分析.结果表明:XJ-04、SD-09和QH-09的全基因组序列同源性高于99.6%,3株BVDV-2分离株与890和NewYork93株亲缘关系最近,属于BVDV-2a亚型.在致细胞病变型的XJ-04、SD-09、QH-09株的NS2/3基因上无外源基因的插入.本研究分离的BVDV-2株为国内首次鉴定国内分离株全基因组序列,为我国BVD的分子流行病调查提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱国强	扬州大学兽医学院	183	1462	21.0	30.0
2	王建业	扬州大学兽医学院	32	211	8.0	13.0
3	朱礼倩	扬州大学兽医学院	10	45	3.0	6.0
4	林燕清	扬州大学兽医学院	4	42	3.0	4.0
5	陶洁	扬州大学兽医学院	10	80	5.0	8.0
6	孙宏进	扬州大学兽医学院	3	22	3.0	3.0
7	孟祥升	扬州大学兽医学院	1	6	1.0	1.0