大白菜乙烯受体基因家族分子特征、微同线性与进化分析

• 作者: 朱红霞 胡利宗 邓小莉
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大白菜 乙烯受体 基因家族 进化
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 88-94
• 分类号: Q522.3
• 字数: 3522字
• 语种: 中文

摘要

采用HMMER与BLAST相结合的方法,在大白菜基因组中挖掘了10个大白菜ERT基因,被命名为BraERT1-10.基因结构分析显示,乙烯受体基因的外显子数目变异大,其范围为1-15.微同线性结果表明,白菜与拟南芥间以及白菜基因组内共有5对基因区段具有较高同线性,每对基因区段间至少共享了8个保守序列模块.蛋白保守结构域和亚细胞定位分析表明,BraERT1、BraERT2和BraERT8都具有N端疏水区域、GAF区、HisKA区、反应调节区,分别被定位于质膜、叶绿体和线粒体；BraERT3、BraERT4和BraERT7虽然有N端疏水区域、GAF区和HisKA区,但没有完整的反应调节区,分别被定位于质膜、质膜和胞质外；其余4个蛋白不具有典型区域,主要定位于核和叶绿体内.进化树结果显示,大白菜ERT基因具有3种类型,分别归属于不同3个类群.本研究为大白菜ERT基因功能研究提供线索,为进一步解析大白菜乙烯信号途径奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱红霞		25	74	5.0	7.0
2	邓小莉		25	136	7.0	10.0
3	胡利宗	中科院遗传发育所	2	2	1.0	1.0