山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析

• 作者: 张红平 李利 李秋 王林杰
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 南江黄羊 IGFBP-5基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 132-137
• 分类号: S827.2
• 字数: 4273字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2011.06.037

摘要

为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetOGlyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点.结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819 bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外.二级结构以无规卷曲为主(83.8％),α-螺旋和延伸片段分别为13.6％和2.6％.N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK 4种.山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89％和94％以上,其N-端在几个物种中完全一致.山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3).山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张红平	四川农业大学动物遗传育种研究所	74	383	10.0	15.0
2	李利	四川农业大学动物遗传育种研究所	53	250	9.0	13.0
3	王林杰	四川农业大学动物遗传育种研究所	16	64	3.0	7.0
4	李秋	四川农业大学动物遗传育种研究所	8	42	3.0	6.0