山羊SDHD基因cDNA编码序列的克隆与分析

• 作者: 岳文斌 李武峰
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 山羊 SDHD基因 分子克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 244-248
• 分类号: S827
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8151.2010.03.013

摘要

利用NCBI中GenBank里查询到已登录的人、猪、牛和绵羊的SDHD mRNA序列,通过多重同源比较,从而获得高度保守区域序列,设计了同源引物,并首次对山羊SDHD编码序列进行了分子克隆.经过PCR扩增和测序,获得山羊SDHD基因共4段cDNA序列,分别为:451 bp、420 bp、529 bp和698 bp.所获得的四段序列测序结果经Lasergene7.0软件SeqMan拼接后,获得一条1238 bp长的cDNA序列.在GenBank数据库中进行BLAST/nr比对,发现其与绵羊、牛、猪和人相应序列相似性分别达98%、97%、85%和81%.用NCBI的ORF Finder软件对已经克隆的山羊SDHD基因cDNA进行开放阅读框分析,发现该序列包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸残基,计算机分析表明(Compute pI/Mw tool),该蛋白的分子量约为17 224.11 Da,等电点为8.92.通过DNAMAN软件分析发现,山羊SDHD蛋白保守性很高,其与绵羊、牛、猪和人SDHD蛋白在氨基酸序列上的相似性分别达到97%、96%、87%和85%.此山羊SDHD基因cDNA序列和SDHD蛋白质序列已于2010年1月31日登录在NCBI的GenBank上,登录号为GU338978和ADB92501.本项研究为进一步研究山羊的SDHD基因作为山羊肉品质性状候选基因,提供了相应的序列信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳文斌	山西农业大学动物科技学院	221	1586	19.0	30.0
2	李武峰	山西农业大学生命科学学院	20	228	7.0	15.0