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摘要:
以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP -6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对 IGFBP -6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊 IGFBP -6基因的 CDS 全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的 CDS 同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%;IGFBP -6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(pI)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊 IGFBP -6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。 IGFBP -6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个 N -糖基化位点和7个 O -糖基化位点;二级结构分析结果显示,IGFBP -6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%;三级结构分析结果显示,IGFBP -6蛋白存在 IGFBP_N 和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。
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文献信息
篇名 绵羊 IGFBP -6基因的克隆及序列分析
来源期刊 河南农业科学 学科 农学
关键词 绵羊 IGFBP - 6 基因 克隆 生物信息学
年,卷(期) 2015,(4) 所属期刊栏目 畜牧? 兽医
研究方向 页码范围 144-148
页数 5页 分类号 S813.3
字数 3175字 语种 中文
DOI 10.15933/j.cnki.1004-3268.2015.04.032
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 吴登俊 四川农业大学动物科技学院 102 797 15.0 24.0
2 周明亮 59 123 6.0 9.0
3 杨平贵 70 158 8.0 10.0
4 张翔宇 43 122 5.0 10.0
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生物信息学
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河南农业科学
月刊
1004-3268
41-1092/S
大16开
郑州市农业路1号
36-32
1972
chi
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