棘腹蛙非伤害性取样DNA提取及16S rRNA基因序列特征分析

• 作者: 徐敬明
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 棘腹蛙 非伤害性取样 DNA提取 PCR扩增 16S rRNA基因 系统发生
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 遗产育种与繁殖
• 页码范围: 41-43
• 页数: 3页
• 分类号: S865.1
• 语种: 中文

摘要

为了改变将两栖类动物处死后从肌肉提取DNA的传统取样方法,试验采用非伤害性取样方法分别从棘腹蛙蹼和趾提取DNA,并以肌肉为对照进行PCR扩增比较.结果表明:蹼和趾的扩增效果与肌肉相当,均能满足获得高质量DNA的试验需求.试验测定了四面山和酉阳棘腹蛙群体的16SrRNA基因部分片段的序列,长度均为530 bp,膘嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)的含量相近,分别为30.2％、22.8％、21.5％、25.5％,30.4％、22.8％、21.5％、25.3％,2个序列间有6个变异位点,核苷酸差异率为1.13％,其中转换5个、颠换1个,转换与颠换比值为5.0.基于已知的棘腹蛙所有16S rRNA基因511 bp同源序列,获得的系统发生树的拓扑结构表明,各群体间遗传分化程度表现为与其分布的地理区域的临近关系及是否存在地理隔离相对应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐敬明		38	182	7.0	12.0