抗原特异TCRα和β链基因克隆及分子空间结构预测

• 作者: 叶静梅 尹青松 李扬秋 李萡 杨力建 谭获 陈少华
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: T细胞受体 CDR3区 同源建模 弥漫大B细胞淋巴瘤
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 349-352
• 分类号: R394-33|R392.12|R394.3
• 语种: 中文

摘要

目的 扩增弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)相关抗原特异T细胞克隆的全长TCR α和β链基因序列,并对其三维空间结构进行预测.方法 从已鉴定的2例伴有克隆性增殖TCR Vα6和Vβ13亚家族T细胞的DLBCL患者外周血中克隆全长TCR α和β基因序列,利用Primer Premier 5.0分析软件推算其相应的氨基酸序列,并通过自动化蛋白质模建服务器SWISS-MODEL进行三维空间结构预测.然后利用蛋白质三维图像分析软件Rasmol 对所获得的TCR三维空间结构进行显示和分析.结果 获得DLBCL相关抗原特异TCR α6和β13全长基因序列及其氨基酸序列.2例患者的TCR Vα6的空间结构与PDB ID:3ffcD模型相似,序列同源性分别为92.16%和91.71%;而2个TCR Vβ13也均具有同一个空间结构模型PDB ID:2ialD,序列同源性分别为92.95%和92.18%.结论 来自不同DLBCL患者外周血中克隆性增殖的TCR Vα6或Vβ13亚家族T细胞的TCR具有高度同源性的空间结构,提示其可能识别相同的肿瘤抗原表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭获	广州医学院第一附属医院肿瘤血液中心	117	274	7.0	10.0
2	李萡	暨南大学医学院血液病研究所	25	59	5.0	5.0
3	杨力建	暨南大学医学院血液病研究所	151	579	10.0	16.0
4	陈少华	暨南大学医学院血液病研究所	170	604	10.0	15.0
5	叶静梅	广州医学院第一附属医院肿瘤血液中心	7	19	3.0	4.0