利用尼罗罗非鱼EST序列筛选免疫抗病相关基因及多态性分析

• 作者: 冯浩 周毅 王凤华 钟欢
• 来源期刊: 中国医师杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 尼罗罗非鱼/遗传学 表达序列标签 免疫抗病 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 动物实验
• 页码范围: 926-929
• 分类号: R383.24
• 字数: 2716字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2012.07.020

摘要

利用生物信息学方法对尼罗罗非鱼ESTs序列进行基因功能注释和免疫抗病基因筛选.研究结果表明,在120991条EST序列中有60852(50.29％)条与已知的斑马鱼蛋白质相匹配,共获得11157个基因,分属于22个生物学功能.其中32个免疫抗病基因中补体因子和趋化因子相关基因有15个基因,占46.88％.结合运用生物信息学软件对补体因子和趋化因子进行多态性SNP分析,共发现8个基因中的140个SNP位点.其中补体c2基因的突变率最高,达7.57％.提示这些基因有较快的进化速率.本文为今后利用公共数据库中ESTs序列分析SNP位点,建立免疫抗病分子标记提供了新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周毅	湖南师范大学生命科学学院	23	125	7.0	10.0
2	冯浩	湖南师范大学生命科学学院	25	425	10.0	20.0
3	钟欢	湖南师范大学生命科学学院	4	13	2.0	3.0