DPP-Ⅳ抑制剂三维药效团模型构建

• 作者: 曹志 李悦青 王希诚 谷俊峰 赵伟杰 韩天佼
• 来源期刊: 化学工程与技术
• 学科: 医学
• 关键词: Ⅱ型糖尿病 二肽基肽酶Ⅳ 药效团模型 数据库搜索
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 53-60
• 页数: 8页
• 分类号: R73

摘要

以20个文献报道的二肽基肽酶Ⅳ(DPP-Ⅳ)抑制剂作为训练集,利用Discovery Studio构建了DPP-Ⅳ抑制剂的三维药效团模型。所得最优药效团模型Hypo1具有一个氢键受体,一个疏水基团,一个可离子化正电中心,一个芳香环和5个排除体积,Fischer交叉验证结果表明该模型具有较高的置信度。Hypo 1对测试集中20个DPP-Ⅳ抑制剂活性进行了预测,结果显示有较好的预测能力。利用该模型进行ZINC数据库搜索,得到预测活性小于10 nmol?L–1的化合物1369个。将这些化合物对接到DPP-Ⅳ的活性位点并根据PLP2评分函数筛选出21个评分较高的化合物,为设计和合成新型的DPP-Ⅳ抑制剂提供了理论参考。