考虑多尺度特征的固有不规则蛋白质预测方法

• 作者: 冯伟兴 王科俊 贺波 陈若雷
• 来源期刊: 哈尔滨工程大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质 不规则结构 预测 集成
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 页码范围: 1138-1143,1149
• 分类号: TP18
• 字数: 5303字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-7043.201110039

摘要

固有不规则蛋白质中长、短不规则结构区域具有明显不同的氨基酸组成,现有的单一预测模型很难同时兼顾两种不规则区域的特征,导致短的不规则区域预测精度降低.为了获取更全面的特征信息,提出一种新的建模方法.针对不规则区域的序列特点,对氨基酸序列进行不同尺度的特征提取并构建基模型,采用双错测度法度量基模型间的差异度,挑选具有较大差异度的基模型进行融合,建立集成预测模型,将集成预测模型的预测结果与窗口中心三肽氨基酸形成不规则结构的统计概率相结合作为最终的预测结果.实验结果表明,所提出的方法能够有效地兼顾到长、短不规则结构区域的特征,大幅提高不规则结构区域的预测精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王科俊	哈尔滨工程大学自动化学院	188	3114	29.0	47.0
2	冯伟兴	哈尔滨工程大学自动化学院	15	115	5.0	10.0
3	陈若雷	哈尔滨工程大学自动化学院	7	5	2.0	2.0
4	贺波	哈尔滨工程大学自动化学院	6	9	2.0	2.0