基于数据挖掘的丙型肝炎患者氨基酸序列与TNF-α间的规律性研究

• 作者: 刘军 周婷婷 孙杰 由莉越 程云 赵庆国 迟淑萍 陈红鸽
• 来源期刊: 北京生物医学工程
• 学科: 医学
• 关键词: 数据挖掘 丙型肝炎 TNF-α 氨基酸序列
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简讯
• 页码范围: 422-424,428
• 分类号: R318
• 字数: 2005字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-3208.2012.04.18.

摘要

目的 研究丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)高度可变区1(hypervariable region 1,HVR1)各位点氨基酸(amino acid,AA)的极性及带电情况与TNF-α表达量之间的规律性.方法 根据样本聚类结果,以HCV的HVR1区域各位点氨基酸的极性及带电情况作为属性,对数据集进行规则挖掘.结果 当aa5为极性不带电氨基酸时,TNF-α表达量下调;当aa5为非极性氨基酸,aa16为极性不带电氨基酸时,TNF-α上调.当aa5和aa16为非极性氨基酸,aa10为极性不带电氨基酸时,TNF -α上调.当aa5、aa16和aa10为非极性氨基酸时,aa19不带电,则TNF-α下调;aa19带电则TNF-α上调.结论 丙型肝炎患者HCV的HVR1区域氨基酸的极性及带电情况与TNF-α的表达量之间具有一定的规律性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘军	中国人民解放军302医院药学部	204	3081	26.0	52.0
2	孙杰	中国人民解放军302医院药学部	32	241	7.0	15.0
3	迟淑萍	中国人民解放军302医院药学部	2	4	1.0	2.0
4	程云	中国人民解放军302医院药学部	3	5	1.0	2.0
5	赵庆国	中国人民解放军302医院药学部	15	102	5.0	10.0
6	陈红鸽	中国人民解放军302医院药学部	9	22	3.0	4.0
7	由莉越	中国人民解放军302医院药学部	1	1	1.0	1.0
8	周婷婷	军事医学科学院基础医学研究所	4	2	1.0	1.0