主养草鱼池塘三种混养模式下鱼类肠道菌群PCR-DGGE比较

• 作者: 余育和 施培松 朱玉婷 熊邦喜 王琴
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鱼类 肠道菌群 PCR-DGGE 16 SrDNA 池塘混养模式
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 308-315
• 分类号: S917.1
• 字数: 5111字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.03.012

摘要

消化道微生物在宿主生长、营养和健康等方面起到重要的作用.本实验采用基于PCR扩增的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术比较研究了主养草鱼(Ctenopharyngodon idellus)池塘三种不同混养模式下的鱼类肠道菌群差异.结果表明,三种混养模式下同种鱼的生长率出现显著性差异(P＜0.05),而肠道细菌16SrDNA V3区特征片段PCR-DGGE指纹分析显示草鱼的肠道菌群相似性较高(＞42.2％)；投喂配合饲料的草鱼与摄食浮游生物的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis和匙吻鲟(Polyodon spathula)肠道菌群结构相差最大(＜19％),鲢和鳙肠道菌群相似性较高(＞41.6％),除模式Ⅱ鳙的肠道和匙吻鲟的胃菌群具有较高的相似性(＞50.3％)外,匙吻鲟的消化道菌群和鲢鳙的相似性低.实验共回收测序了14条特定DGGE条带中的DNA片段,并进行系统进化分析,结果显示,这14条条带分别归属于4个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),厚壁菌门(Firmicutes)和梭杆菌门(Fusobacteria).研究结果为鱼类混养模式的优化,饲料研发和鱼病防治提供了基础参考资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊邦喜	华中农业大学水产学院	109	1798	26.0	35.0
2	余育和	中国科学院水生生物研究所	52	738	16.0	25.0
3	王琴	华中农业大学水产学院	8	66	6.0	8.0
4	朱玉婷	华中农业大学水产学院	7	54	4.0	7.0
5	施培松	华中农业大学水产学院	6	61	4.0	6.0