铁皮石斛微卫星SSR设计与应用

• 作者: 张智俊 管雨 肖冬长
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 铁皮石斛 微卫星 SSR 多态性
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 88-92
• 分类号: S567.239
• 字数: 3039字
• 语种: 中文

摘要

通过Websat对来源于NCBI公共数据库的2447条石斛属(Dendrobium)核苷酸序列进行简单重复序列SSR的搜索,剔徐冗余序列后,找到124个SSR位点.利用primer3.0软件设计引物75对,并通过改良的方法提取铁皮石斛DNA作为模板,对铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)的SSR引物进行筛选,选出21对有较清晰且稳定的目标扩增产物的引物,对8个种源的铁皮石斛进行多态性分析和聚类分析,得到8个种源的铁皮石斛进行遗传多样性和亲缘关系.