尾索动物线粒体基因组特征比较及分子系统发育

• 作者: 孟学平 李士虎 田美 申欣 程汉良
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 尾索动物 线粒体基因组 基因排列 分子标记 分子系统发育
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 页码范围: 30-37
• 分类号: Q959.284
• 语种: 中文

摘要

为全面揭示尾索动物线粒体基因组的基本特征,作者系统分析了12种尾索动物的线粒体基因组全序列,尾索动物线粒体基因组所有的基因均在同一链上编码,这与脊椎动物、头索动物线粒体基因组的基因分布特征显著不同.与后生动物线粒体基因组标准的基因组成相比,尾索动物线粒体基因组存在转运 RNA基因的增加以及部分物种 atp8基因的缺失.在尾索动物线粒体基因组中发生了大规模的基因重排,即使在同属物种的线粒体基因组中,也存在主编码基因的基因重排及基因缺失.尾索动物线粒体基因组蛋白质编码基因的起始密码子、终止密码子及氨基酸长度存在明显差异.2个玻璃海鞘(Ciona intestinalis 和 C. savignyi)线粒体基因组12个蛋白质编码基因的 Ka/Ks 比值都低于1(0.0927~0.6752),显示出一定的负选择.在所有的主编码基因中, nad5基因和nad4基因的变异位点最多,可以作为备选的分子标记,用于分析尾索动物不同物种之间的生物多样性.基于线粒体基因组的系统发育分析,支持尾索动物在科级的亲缘关系为:(((柄海鞘科 Pyuridae+芋海鞘科 Styelidae)+(((三段海鞘科Polyclinidae+星骨海鞘科Didemnidae)+簇海鞘科Clavelinidae)+玻璃海鞘科Cionidae))+长纹海鞘科Ascidiidae)+海樽科Doliolidae.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院	37	175	8.0	11.0
2	田美	淮海工学院海洋学院	24	134	7.0	10.0
3	孟学平	淮海工学院海洋学院	46	339	11.0	15.0
4	程汉良	淮海工学院海洋学院	62	727	14.0	24.0
5	李士虎	淮海工学院海洋学院	49	296	8.0	15.0