津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

• 作者: 兰青阔 张继波 徐石勇 朱珠 李欧静 王永 赵新 郭永泽 陈锐
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 芹菜 SSR标记 指纹图谱 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 7-11
• 分类号: S636.3
• 字数: 2525字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2012.05.002

摘要

以天津市津南11个芹菜育种材料为研究对象,利用EST-SSR分子标记技术构建津南芹菜分子指纹图谱,并用于遗传多样性分析.从GenBank数据库查询芹菜EST序列1 122条,使用BatchPrimer3在线软件扫描分析获得194个候选EST-SSR位点,并设计141对SSR-PCR引物.选择其中47对引物进行多态性分析,确认8对引物具有多态性.构建基于Excel格式的津南芹菜EST-SSR指纹图谱,包括8对引物在供试材料中扩增到的44条多态性条带信息.遗传多样性分析显示,供试材料间遗传相似系数介于0.409～0.864之间,平均为0.664.本研究建立的津南芹菜EST-SSR指纹图谱稳定有效,可用于芹菜种质资源鉴定和品种真实性检测.