牛鞭草品种EST-SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

• 作者: 刘欢 张博涛 张新全 张瑜 曾捷 聂刚 蒋晓梅 黄琳凯 黄秀
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: EST-SSR 牛鞭草属 品种 DNA指纹图谱 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 165-171
• 页数: 7页
• 字数: 3966字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2014.02.009

摘要

为探讨牛鞭草(Hemarthria spp.)品种间的遗传多样性，从86对EST-SSR引物中筛选出8对引物对牛鞭草属6个品种进行指纹图谱的构建及遗传多样性分析。结果表明，8对EST-SSR引物对牛鞭草属6个品种共扩增出193条清晰条带，多态性条带161条，多态性比例为83.4%。每条引物的多态信息含量(PIC)为0.480~0.695，平均为0.602。UPGMA聚类分析表明，牛鞭草属6个品种在相似系数为0.652处可分为两大类群。8对EST-SSR引物均能将6个品种完全区分开，以3对EST-SSR引物扩增的电泳图谱为基础，建立了牛鞭草属6个品种的指纹图谱标准模式图，每个品种都有唯一的指纹图谱。牛鞭草属6个品种的平均Nei’s基因多样性指数为0.333，平均Shannon信息指数为0.496，品种间的相似系数介于0.399~0.782之间。可见，牛鞭草属植物品种的遗传多样性较丰富，种间差异明显。