高维生物学数据两阶段组合降维策略研究

• 作者: 于浩 荀鹏程 赵杨 钱国华 陈峰
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 关键词: 两阶段组合降维 偏最小二乘 切片逆回归 切片均方误差估计 微阵列数据 判别分析
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 626-629
• 页数: 4页
• 字数: 3628字
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨高维生物学数据的多阶段组合降维策略.方法 以微阵列数据的判别分析为例,采用实际数据和模拟数据相结合的方法,提出“初步选维→进一步降维”的两阶段组合降维策略,并与后续的“判别→验证”相结合,形成了“选维→降维→判别→验证”的判别分析思路.以后续判别分析的预测效果、预测结果的稳定性与敏感性等为指标,对2种单一降维( PCA,PLS)方法和4种组合降维方法(PCA+ SIR、PCA+SAVE、PLS+ SIR和PLS+ SAVE)进行了考察.结果 从判别模型的预测效果、预测结果的稳定性及敏感性来看,PLS优于PCA,PLS+ SIR/SAVE的组合降维效果更佳.结论 用t计分法选维,以“PLS+SIR/SAVE”法进行降维的两阶段组合降维策略,对于微阵列数据判别分析,是实用的、可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈峰	南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	202	1688	19.0	32.0
5	荀鹏程	南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	21	220	9.0	14.0
9	赵杨	南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	86	628	13.0	21.0
13	于浩	南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	111	1247	18.0	31.0
17	钱国华		5	11	3.0	3.0